参照 

http://blog.smallserver.jp/raspberry-pi-%e7%94%a8%e3%81%aesd%e3%82%ab%e3%83%bc%e3%83%89%e3%82%92%e5%88%9d%e6%9c%9f%e5%8c%96%e3%81%99%e3%82%8b%e6%96%b9%e6%b3%95/ 

Raspberry Pi 用のSDカードを初期化する方法

RaspberryPiで使用していたSDカードの中身を入れ替えようとWindowsのPCでカードリーダーから読み込ませた場合、パーティションの情報をうまく認識することができません。
今回はSDカード内のパーティションをすべて削除し、何も書き込まれていない状態に戻す方法を紹介します。

初期化前の状況

RaspberryPiで使用していたSDカード（16GB）をカードリーダで読ませると次の様になります。２つの領域に分かれてしまっている上に、認識できた部分の領域は100MB弱しかありません。

初期化の手順

コマンドプロンプトを開き、コマンドラインから「diskpart」と入力してエンターキーを押します。なお実行時には許可を求められます。

別のウインドウでDiskPartが起動します。

「list disk」と入力してエンターキーを押してください。接続されているディスクが表示されます。
ディスク容量が16GBに近いディスク1が初期化するSDカードとなります。間違ってディスク0を消すとPCが起動しなくなるのでご注意を。

「select disk 1」と入力してエンターキーを押してください。ここでディスク1に対し設定を行うことを宣言します。

再度「list disk」と入力してエンターキーを押してください。ディスク1に印(*)がついており、ディスクが選択されていることが確認できます。

「list partition」と入力してエンターキーを押してください。SDカードのパーティションの一覧が表示されます。２つのパーティションが表示されているのがわかります。

すべてのパーティションを削除します。なお、Windows上でSDカード内を開いたままだとエラーになりますので、エクスプローラなどはすべて閉じた上で、再度コマンドを実行してください。正常にパーティションを削除すると次のメッセージが表示されます。

再度「list partition」と入力してエンターキーを押してください。パーティションが全くないことが確認できます。

マイコンピュータを開いてもドライブが１つになり、フォーマットしていない状態なので容量も表示されません。

あとはmicroSDカードにOSイメージを書き込む方法を参考にOSイメージを書き込んでください。